Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35aO55142 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms