Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PrxO55103 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PrxO55103 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PrxO55103 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PrxO55103 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PrxO55103 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PrxO55103 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PrxO55103 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PrxO55103 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PrxO55103 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PrxO55103 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PrxO55103 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PrxO55103 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PrxO55103 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PrxO55103 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PrxO55103 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PrxO55103 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PrxO55103 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PrxO55103 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PrxO55103 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PrxO55103 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PrxO55103 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PrxO55103 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PrxO55103 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PrxO55103 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PrxO55103 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PrxO55103 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PrxO55103 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PrxO55103 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PrxO55103 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PrxO55103 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PrxO55103 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PrxO55103 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PrxO55103 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PrxO55103 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PrxO55103 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PrxO55103 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PrxO55103 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PrxO55103 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PrxO55103 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PrxO55103 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PrxO55103 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PrxO55103 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PrxO55103 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PrxO55103 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PrxO55103 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PrxO55103 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PrxO55103 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PrxO55103 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PrxO55103 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PrxO55103 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PrxO55103 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PrxO55103 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PrxO55103 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PrxO55103 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PrxO55103 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PrxO55103 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PrxO55103 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PrxO55103 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PrxO55103 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PrxO55103 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PrxO55103 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PrxO55103 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PrxO55103 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PrxO55103 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PrxO55103 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PrxO55103 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PrxO55103 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PrxO55103 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PrxO55103 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PrxO55103 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PrxO55103 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PrxO55103 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PrxO55103 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PrxO55103 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PrxO55103 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PrxO55103 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PrxO55103 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PrxO55103 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PrxO55103 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PrxO55103 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PrxO55103 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PrxO55103 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PrxO55103 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PrxO55103 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PrxO55103 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PrxO55103 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PrxO55103 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PrxO55103 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PrxO55103 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PrxO55103 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PrxO55103 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PrxO55103 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PrxO55103 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PrxO55103 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PrxO55103 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PrxO55103 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PrxO55103 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PrxO55103 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PrxO55103 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms