Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nck2O55033 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nck2O55033 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nck2O55033 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nck2O55033 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nck2O55033 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nck2O55033 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nck2O55033 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nck2O55033 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nck2O55033 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nck2O55033 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nck2O55033 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nck2O55033 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nck2O55033 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nck2O55033 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nck2O55033 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nck2O55033 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nck2O55033 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nck2O55033 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms