Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnk2O54967 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnk2O54967 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnk2O54967 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnk2O54967 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnk2O54967 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnk2O54967 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnk2O54967 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnk2O54967 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnk2O54967 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tnk2O54967 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnk2O54967 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms