Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LatO54957 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LatO54957 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LatO54957 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LatO54957 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LatO54957 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LatO54957 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LatO54957 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LatO54957 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LatO54957 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LatO54957 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LatO54957 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LatO54957 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LatO54957 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LatO54957 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LatO54957 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LatO54957 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LatO54957 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LatO54957 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LatO54957 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LatO54957 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LatO54957 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LatO54957 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LatO54957 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LatO54957 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LatO54957 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LatO54957 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LatO54957 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LatO54957 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LatO54957 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LatO54957 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LatO54957 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LatO54957 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LatO54957 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LatO54957 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LatO54957 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LatO54957 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LatO54957 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LatO54957 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LatO54957 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LatO54957 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LatO54957 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LatO54957 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LatO54957 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LatO54957 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LatO54957 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LatO54957 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LatO54957 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LatO54957 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LatO54957 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LatO54957 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LatO54957 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LatO54957 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LatO54957 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LatO54957 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LatO54957 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LatO54957 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LatO54957 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LatO54957 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LatO54957 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LatO54957 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LatO54957 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LatO54957 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LatO54957 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LatO54957 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LatO54957 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LatO54957 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LatO54957 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LatO54957 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LatO54957 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LatO54957 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LatO54957 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LatO54957 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LatO54957 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LatO54957 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LatO54957 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LatO54957 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LatO54957 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LatO54957 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LatO54957 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LatO54957 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LatO54957 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LatO54957 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LatO54957 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LatO54957 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LatO54957 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LatO54957 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LatO54957 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LatO54957 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LatO54957 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LatO54957 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LatO54957 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LatO54957 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LatO54957 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LatO54957 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LatO54957 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LatO54957 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LatO54957 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LatO54957 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LatO54957 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms