Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pole2O54956 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pole2O54956 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pole2O54956 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pole2O54956 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pole2O54956 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms