Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnajb6O54946 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnajb6O54946 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dnajb6O54946 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dnajb6O54946 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnajb6O54946 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnajb6O54946 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms