Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb3O54890 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb3O54890 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Itgb3O54890 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms