Protein–RNA interactions for Protein: O54732

Mmp15, Matrix metalloproteinase-15, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp15O54732 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp15O54732 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp15O54732 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp15O54732 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp15O54732 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp15O54732 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp15O54732 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp15O54732 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp15O54732 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp15O54732 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp15O54732 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp15O54732 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp15O54732 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp15O54732 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp15O54732 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp15O54732 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp15O54732 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp15O54732 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp15O54732 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp15O54732 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp15O54732 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mmp15O54732 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp15O54732 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms