Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccr6O54689 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr6O54689 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccr6O54689 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms