Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdc4O35988 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdc4O35988 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdc4O35988 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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