Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab33bO35963 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab33bO35963 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab33bO35963 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab33bO35963 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab33bO35963 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab33bO35963 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab33bO35963 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab33bO35963 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab33bO35963 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab33bO35963 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab33bO35963 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab33bO35963 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab33bO35963 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab33bO35963 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab33bO35963 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab33bO35963 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms