Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek2O35942 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek2O35942 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nek2O35942 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek2O35942 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek2O35942 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek2O35942 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek2O35942 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek2O35942 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek2O35942 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek2O35942 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek2O35942 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms