Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Pik3cdO35904 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pik3cdO35904 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms