Protein–RNA interactions for Protein: O35718

Socs3, Suppressor of cytokine signaling 3, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs3O35718 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Socs3O35718 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Socs3O35718 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Socs3O35718 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Socs3O35718 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Socs3O35718 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Socs3O35718 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Socs3O35718 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Socs3O35718 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms