Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stag2O35638 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stag2O35638 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stag2O35638 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Stag2O35638 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stag2O35638 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stag2O35638 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stag2O35638 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stag2O35638 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stag2O35638 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stag2O35638 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stag2O35638 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stag2O35638 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stag2O35638 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms