Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clk2O35491 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Clk2O35491 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clk2O35491 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clk2O35491 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clk2O35491 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clk2O35491 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clk2O35491 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clk2O35491 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clk2O35491 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clk2O35491 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms