Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KeraO35367 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KeraO35367 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KeraO35367 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KeraO35367 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KeraO35367 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KeraO35367 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KeraO35367 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KeraO35367 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KeraO35367 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KeraO35367 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KeraO35367 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
KeraO35367 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KeraO35367 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KeraO35367 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KeraO35367 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KeraO35367 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KeraO35367 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KeraO35367 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KeraO35367 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KeraO35367 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KeraO35367 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KeraO35367 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KeraO35367 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KeraO35367 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KeraO35367 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KeraO35367 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KeraO35367 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KeraO35367 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KeraO35367 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KeraO35367 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KeraO35367 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KeraO35367 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KeraO35367 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KeraO35367 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KeraO35367 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KeraO35367 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KeraO35367 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KeraO35367 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KeraO35367 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KeraO35367 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KeraO35367 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KeraO35367 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KeraO35367 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KeraO35367 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KeraO35367 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KeraO35367 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KeraO35367 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KeraO35367 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KeraO35367 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KeraO35367 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KeraO35367 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KeraO35367 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KeraO35367 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KeraO35367 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KeraO35367 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KeraO35367 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KeraO35367 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KeraO35367 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KeraO35367 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KeraO35367 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KeraO35367 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KeraO35367 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KeraO35367 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KeraO35367 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KeraO35367 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KeraO35367 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KeraO35367 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KeraO35367 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KeraO35367 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KeraO35367 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KeraO35367 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KeraO35367 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KeraO35367 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KeraO35367 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KeraO35367 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KeraO35367 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KeraO35367 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KeraO35367 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KeraO35367 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KeraO35367 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KeraO35367 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KeraO35367 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KeraO35367 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KeraO35367 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KeraO35367 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KeraO35367 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KeraO35367 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KeraO35367 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KeraO35367 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KeraO35367 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KeraO35367 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KeraO35367 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KeraO35367 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KeraO35367 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KeraO35367 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KeraO35367 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KeraO35367 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KeraO35367 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KeraO35367 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms