Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dgcr6O35347 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms