Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc18a3O35304 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc18a3O35304 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc18a3O35304 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc18a3O35304 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc18a3O35304 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc18a3O35304 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc18a3O35304 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc18a3O35304 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc18a3O35304 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc18a3O35304 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc18a3O35304 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms