Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pkd2O35245 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pkd2O35245 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pkd2O35245 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Pkd2O35245 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Pkd2O35245 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pkd2O35245 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms