Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Ptpn9O35239 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Ptpn9O35239 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Ptpn9O35239 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn9O35239 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Ptpn9O35239 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Ptpn9O35239 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn9O35239 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn9O35239 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Ptpn9O35239 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Ptpn9O35239 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Ptpn9O35239 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Ptpn9O35239 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Ptpn9O35239 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn9O35239 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Ptpn9O35239 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Ptpn9O35239 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms