Protein–RNA interactions for Protein: O35218

Cpsf2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf2O35218 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpsf2O35218 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cpsf2O35218 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms