Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ArxO35085 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ArxO35085 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ArxO35085 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ArxO35085 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ArxO35085 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ArxO35085 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ArxO35085 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ArxO35085 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ArxO35085 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ArxO35085 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ArxO35085 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ArxO35085 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ArxO35085 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ArxO35085 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ArxO35085 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ArxO35085 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ArxO35085 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ArxO35085 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ArxO35085 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ArxO35085 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ArxO35085 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ArxO35085 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ArxO35085 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ArxO35085 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ArxO35085 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ArxO35085 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ArxO35085 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ArxO35085 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ArxO35085 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ArxO35085 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ArxO35085 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ArxO35085 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ArxO35085 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ArxO35085 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ArxO35085 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ArxO35085 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ArxO35085 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ArxO35085 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ArxO35085 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ArxO35085 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ArxO35085 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ArxO35085 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ArxO35085 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ArxO35085 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ArxO35085 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ArxO35085 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ArxO35085 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ArxO35085 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ArxO35085 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ArxO35085 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ArxO35085 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ArxO35085 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ArxO35085 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ArxO35085 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ArxO35085 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ArxO35085 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ArxO35085 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ArxO35085 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ArxO35085 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ArxO35085 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ArxO35085 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ArxO35085 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ArxO35085 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ArxO35085 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ArxO35085 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ArxO35085 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ArxO35085 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ArxO35085 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ArxO35085 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ArxO35085 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ArxO35085 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ArxO35085 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ArxO35085 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ArxO35085 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ArxO35085 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ArxO35085 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ArxO35085 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ArxO35085 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ArxO35085 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ArxO35085 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ArxO35085 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ArxO35085 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ArxO35085 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ArxO35085 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ArxO35085 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ArxO35085 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ArxO35085 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ArxO35085 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ArxO35085 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ArxO35085 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ArxO35085 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ArxO35085 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ArxO35085 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ArxO35085 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ArxO35085 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ArxO35085 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ArxO35085 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ArxO35085 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ArxO35085 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms