Protein–RNA interactions for Protein: O35074

Ptgis, Prostacyclin synthase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgisO35074 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtgisO35074 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtgisO35074 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtgisO35074 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtgisO35074 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtgisO35074 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtgisO35074 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtgisO35074 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtgisO35074 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtgisO35074 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtgisO35074 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtgisO35074 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtgisO35074 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtgisO35074 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtgisO35074 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PtgisO35074 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtgisO35074 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtgisO35074 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtgisO35074 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtgisO35074 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PtgisO35074 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PtgisO35074 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtgisO35074 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms