Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Q1O19441 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Q1O19441 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Q1O19441 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Q1O19441 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-Q1O19441 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Q1O19441 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Q1O19441 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Q1O19441 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Q1O19441 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Q1O19441 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Q1O19441 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Q1O19441 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Q1O19441 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-Q1O19441 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-Q1O19441 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-Q1O19441 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-Q1O19441 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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H2-Q1O19441 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-Q1O19441 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-Q1O19441 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-Q1O19441 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-Q1O19441 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-Q1O19441 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-Q1O19441 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Q1O19441 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-Q1O19441 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
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H2-Q1O19441 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-Q1O19441 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Q1O19441 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Q1O19441 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Q1O19441 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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H2-Q1O19441 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Q1O19441 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Q1O19441 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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H2-Q1O19441 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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H2-Q1O19441 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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H2-Q1O19441 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-Q1O19441 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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H2-Q1O19441 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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H2-Q1O19441 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Q1O19441 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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H2-Q1O19441 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Q1O19441 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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H2-Q1O19441 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Q1O19441 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Q1O19441 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Q1O19441 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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H2-Q1O19441 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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H2-Q1O19441 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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H2-Q1O19441 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Q1O19441 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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