Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Dctn1O08788 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Dctn1O08788 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dctn1O08788 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms