Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CckarO08786 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CckarO08786 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CckarO08786 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CckarO08786 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CckarO08786 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CckarO08786 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CckarO08786 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CckarO08786 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CckarO08786 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CckarO08786 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CckarO08786 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CckarO08786 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CckarO08786 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CckarO08786 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CckarO08786 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CckarO08786 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CckarO08786 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CckarO08786 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CckarO08786 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CckarO08786 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CckarO08786 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CckarO08786 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CckarO08786 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CckarO08786 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CckarO08786 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CckarO08786 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CckarO08786 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CckarO08786 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CckarO08786 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CckarO08786 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CckarO08786 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CckarO08786 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CckarO08786 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CckarO08786 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CckarO08786 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CckarO08786 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CckarO08786 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CckarO08786 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CckarO08786 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CckarO08786 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CckarO08786 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CckarO08786 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CckarO08786 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CckarO08786 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CckarO08786 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CckarO08786 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CckarO08786 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CckarO08786 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CckarO08786 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CckarO08786 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CckarO08786 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CckarO08786 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CckarO08786 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CckarO08786 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CckarO08786 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CckarO08786 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CckarO08786 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CckarO08786 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CckarO08786 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CckarO08786 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CckarO08786 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CckarO08786 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CckarO08786 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CckarO08786 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CckarO08786 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CckarO08786 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CckarO08786 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CckarO08786 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CckarO08786 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CckarO08786 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CckarO08786 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CckarO08786 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CckarO08786 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CckarO08786 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CckarO08786 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CckarO08786 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CckarO08786 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CckarO08786 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CckarO08786 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CckarO08786 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CckarO08786 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CckarO08786 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CckarO08786 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CckarO08786 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CckarO08786 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CckarO08786 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CckarO08786 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CckarO08786 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CckarO08786 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CckarO08786 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CckarO08786 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CckarO08786 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CckarO08786 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CckarO08786 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CckarO08786 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CckarO08786 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CckarO08786 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CckarO08786 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CckarO08786 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms