Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ube3aO08759 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms