Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Barx2O08686 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Barx2O08686 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Barx2O08686 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Barx2O08686 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Barx2O08686 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Barx2O08686 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Barx2O08686 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Barx2O08686 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Barx2O08686 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Barx2O08686 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Barx2O08686 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Barx2O08686 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Barx2O08686 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Barx2O08686 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Barx2O08686 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Barx2O08686 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Barx2O08686 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Barx2O08686 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Barx2O08686 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Barx2O08686 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Barx2O08686 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Barx2O08686 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Barx2O08686 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Barx2O08686 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Barx2O08686 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Barx2O08686 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Barx2O08686 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Barx2O08686 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Barx2O08686 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Barx2O08686 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Barx2O08686 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Barx2O08686 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Barx2O08686 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Barx2O08686 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Barx2O08686 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Barx2O08686 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Barx2O08686 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Barx2O08686 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Barx2O08686 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms