Protein–RNA interactions for Protein: L7N1X0

Gm28044, Predicted gene, 28044, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28044L7N1X0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28044L7N1X0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28044L7N1X0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms