Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21887J3QQ04 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms