Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top6blJ3QMY9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top6blJ3QMY9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top6blJ3QMY9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top6blJ3QMY9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top6blJ3QMY9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top6blJ3QMY9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top6blJ3QMY9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top6blJ3QMY9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top6blJ3QMY9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top6blJ3QMY9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top6blJ3QMY9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Top6blJ3QMY9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Top6blJ3QMY9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top6blJ3QMY9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top6blJ3QMY9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Top6blJ3QMY9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Top6blJ3QMY9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Top6blJ3QMY9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms