Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm21060J3KMU4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm21060J3KMU4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms