Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r67G5E8C1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r67G5E8C1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms