Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vmn1r58G3X9U3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r58G3X9U3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms