Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf148G3X9R7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf148G3X9R7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf148G3X9R7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf148G3X9R7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms