Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Susd5G3UW60 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Susd5G3UW60 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Susd5G3UW60 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Susd5G3UW60 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms