Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XntrpcF8VQM8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XntrpcF8VQM8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms