Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ScaperF8VQ70 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ScaperF8VQ70 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms