Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LctF8VPT3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LctF8VPT3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LctF8VPT3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms