Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arid4aF8VPQ2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arid4aF8VPQ2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arid4aF8VPQ2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arid4aF8VPQ2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Arid4aF8VPQ2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arid4aF8VPQ2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arid4aF8VPQ2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arid4aF8VPQ2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arid4aF8VPQ2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arid4aF8VPQ2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arid4aF8VPQ2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arid4aF8VPQ2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arid4aF8VPQ2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arid4aF8VPQ2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arid4aF8VPQ2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms