Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
D430041D05RikF6ZGR6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
D430041D05RikF6ZGR6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
D430041D05RikF6ZGR6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
D430041D05RikF6ZGR6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
D430041D05RikF6ZGR6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
D430041D05RikF6ZGR6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
D430041D05RikF6ZGR6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
D430041D05RikF6ZGR6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
D430041D05RikF6ZGR6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
D430041D05RikF6ZGR6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
D430041D05RikF6ZGR6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
D430041D05RikF6ZGR6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
D430041D05RikF6ZGR6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
D430041D05RikF6ZGR6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
D430041D05RikF6ZGR6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
D430041D05RikF6ZGR6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
D430041D05RikF6ZGR6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
D430041D05RikF6ZGR6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
D430041D05RikF6ZGR6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
D430041D05RikF6ZGR6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
D430041D05RikF6ZGR6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC29■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
D430041D05RikF6ZGR6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
D430041D05RikF6ZGR6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms