Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pagr1bF6V0H0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pagr1bF6V0H0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pagr1bF6V0H0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pagr1bF6V0H0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pagr1bF6V0H0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pagr1bF6V0H0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pagr1bF6V0H0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pagr1bF6V0H0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pagr1bF6V0H0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pagr1bF6V0H0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pagr1bF6V0H0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pagr1bF6V0H0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pagr1bF6V0H0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pagr1bF6V0H0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pagr1bF6V0H0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pagr1bF6V0H0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pagr1bF6V0H0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pagr1bF6V0H0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pagr1bF6V0H0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pagr1bF6V0H0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pagr1bF6V0H0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pagr1bF6V0H0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pagr1bF6V0H0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pagr1bF6V0H0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pagr1bF6V0H0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pagr1bF6V0H0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pagr1bF6V0H0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms