Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm28305F6U473 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms