Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3072F6SKY8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3072F6SKY8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms