Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Erich3F6QRE9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Erich3F6QRE9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Erich3F6QRE9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Erich3F6QRE9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Erich3F6QRE9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Erich3F6QRE9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Erich3F6QRE9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Erich3F6QRE9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Erich3F6QRE9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Erich3F6QRE9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Erich3F6QRE9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Erich3F6QRE9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Erich3F6QRE9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Erich3F6QRE9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Erich3F6QRE9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Erich3F6QRE9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Erich3F6QRE9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Erich3F6QRE9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Erich3F6QRE9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Erich3F6QRE9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Erich3F6QRE9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Erich3F6QRE9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Erich3F6QRE9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Erich3F6QRE9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Erich3F6QRE9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Erich3F6QRE9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Erich3F6QRE9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Erich3F6QRE9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Erich3F6QRE9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Erich3F6QRE9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Erich3F6QRE9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Erich3F6QRE9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Erich3F6QRE9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Erich3F6QRE9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms