Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Y4

A430078G23Rik, RIKEN cDNA A430078G23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
A430078G23RikE9Q7Y4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A430078G23RikE9Q7Y4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A430078G23RikE9Q7Y4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.8 ms