Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U8

Vmn2r35, Vomeronasal 2, receptor 35, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r35E9Q7U8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn2r35E9Q7U8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn2r35E9Q7U8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn2r35E9Q7U8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn2r35E9Q7U8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn2r35E9Q7U8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn2r35E9Q7U8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn2r35E9Q7U8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn2r35E9Q7U8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn2r35E9Q7U8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn2r35E9Q7U8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn2r35E9Q7U8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn2r35E9Q7U8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn2r35E9Q7U8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn2r35E9Q7U8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn2r35E9Q7U8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn2r35E9Q7U8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn2r35E9Q7U8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn2r35E9Q7U8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms