Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm5407E9Q7Q1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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Gm5407E9Q7Q1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm5407E9Q7Q1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm5407E9Q7Q1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm5407E9Q7Q1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm5407E9Q7Q1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm5407E9Q7Q1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm5407E9Q7Q1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm5407E9Q7Q1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm5407E9Q7Q1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm5407E9Q7Q1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm5407E9Q7Q1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm5407E9Q7Q1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm5407E9Q7Q1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm5407E9Q7Q1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm5407E9Q7Q1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm5407E9Q7Q1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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